一套完整的分子蒸馏设备主要包括：分子蒸发器、脱气系统、进料系统、加热系统、冷却真空系统和控制系统。装置的核心部分是分子蒸发器，其种类主要有3种：（1）降膜式：为早期形式，结构简单，但由于液膜厚，效率差，现如今很少采用；（2）刮膜式：形成的液膜薄，分离效率高，但较降膜式结构复杂；（3）离心式：离心力成膜，膜薄，蒸发效率高，但结构复杂，真空密封较难，设备的制造成本高。为提高分离效率，往往需要采用多级串联使用而实现不同物质的多级分离。

       离心式分子蒸馏设备离心力成膜，膜薄，蒸发效率高。但结构复杂，制造及操作难度大。该装置将物料送到高速旋转的转盘中间，并在旋转面扩展形成薄膜，同时加热蒸发，使之与对面的冷凝面凝缩，该装置是较为理想的蒸馏装置。但与其它两种装置相比，要求有高速旋转的转盘，又需要较高的真空密封技术。

       离心式分子蒸馏设备具有以下优点：由于转盘高速旋转，可得到很薄的液膜且液膜分布更均匀，蒸发速率和分离效率更好；物料在蒸发面上的受热时间更短，降低了热敏物质热分解的危害；物料的处理量更大，适合工业上的连续生产。